本書(一冊一六一面九六、六００字)不分卷，王元穉輯。元穉，福建閩縣人。清同治十三年(甲戌)，嘗客臺灣道幕。當年日本因藉口琉球難民被臺灣先住民殺害事件出兵臺灣，元穉因在道署，得將有關此案公牘錄存副本，輯編成書。全書共載一百七十九件文牘，除二十件奏章及十七件上諭與第三八種「同治甲戌日兵侵臺始末」所載相同外，其餘多為原始資料。其中以委員周有基探報十二件、華廷錫與袁聞柝探報二件、鄭秉機探報十七件暨地方文武如枋寮巡檢王懋功、千總郭占鰲、遊擊王開俊、鳳山知縣李瑛、孫繼祖等稟報二十五件以及未具職銜姓名「另紙探報」二十件(共計七十八件)，幾乎將日人在臺舉動逐日查明紀錄，史料價值極高；另有地方官吏與日本帶兵官辦理交涉之談話紀錄，亦至有價值。本書如與「日兵侵臺始末」相較，前者內容重在日兵侵臺事件實地發展情況，後者內容重在清廷辦理此一事件之經過；兩書各有特色，缺一不可。本書係據臺灣省立圖書館所藏抄本整理編印。